Lionel Navarro

Les mécanismes de suppression de la voie microARN par les bactéries pathogènes.

     La réponse immunitaire innée constitue la première ligne de défense contre les microbes. Cette réponse est induite après reconnaissance de motifs moléculaires microbiens par des récepteurs cellulaires de l’hôte. Les plantes comme les animaux sont capables d’identifier comme « non-soi » de tels motifs bien conservés au cours de l’évolution et d’induire l’expression différentielle de nombreux genes, parmi lesquels des microARN (miARN) ont été identifiés. Ces petits ARN contrôlent l’expression des gènes au niveau post-transcriptionnel en dégradant des ARN messagers cibles et/ou en bloquant leur traduction en protéine.

     Les travaux antérieurs de Lionel Navarro ont permis d’identifier et de caractériser le premier microARN impliqué dans la défense antibactérienne. Une étude ultérieure a également montré qu’un mutant de Pseudomonas syringae dont le système de sécrétion (type III*) est non-fonctionnel et des bactéries non-pathogènes, ont la capacité de se multiplier dans des mutants d’Arabidopsis dépourvus de miARN. Ceci souligne le rôle majeur de la voie miARN dans l’immunité innée antibactérienne. En accord avec ces découvertes, plusieurs protéines de sécrétion de type III de P. syringae ont la capacité de supprimer la voie miARN, cependant, les mécanismes d’actions de ces suppresseurs bactériens restent encore inconnus. Lionel Navarro et son équipe étudient ces mécanismes de suppression et tente de comprendre comment les plantes contrecarrent ce processus. Elle vise également à établir si les bactéries pathogènes de l’homme utilisent des mécanismes analogues de suppression de la voie miARN.

Rôle de la méthylation de l’ADN dirigée par petits ARN dans la régulation épigénétique de la réponse immunitaire et dans l’évolution des gènes de résistance aux pathogènes .

     Chez les eucaryotes supérieurs, la grande majorité du génome est apparemment transcrite, ce qui donne naissance à une très grande diversité d’ARN non-codants. Bien que le rôle fonctionnel de ces ARN demeure largement inconnu, plusieurs études suggèrent que ces molécules puissent être impliquées dans des mécanismes de régulations épigénétiques. Chez les plantes supérieures, une proportion significative des ARN non-codants est maturée en siARN par la machinerie du RNA silencing. Certains d’entre eux ciblent de manière séquence-spécifique la méthylation de l’ADN via un processus appelé RdDM (pour ‘RNA-directed DNA méthylation’). La voie RdDM contribue à l’extinction transcriptionnelle (TGS) d’éléments transposables ainsi que de certains gènes contenant des reliques de transposons ou des répétitions dans leurs régions promotrices.

     Lionel Navarro et son équipe étudient le rôle ainsi que les mécanismes de régulation de la voie TGS dans la réponse immunitaire innée chez Arabidopsis. Elle vise également à établir si les bactéries interfèrent directement avec la voie TGS pour promouvoir la pathogénécité bactérienne. Elle étudie enfin l’éventuelle contribution de la voie RdDM dans les mécanismes de défense transgénérationnelle ainsi que dans l’évolution des gènes de résistance aux agents pathogènes.

Plante d’Arabidospis rapportant l’activité ‘épigénétique’ de petits ARN