Reini F. Luco

Introduction

L’épissage alternatif est l’un des processus biologiques les plus généraux et les plus importants de la cellule eucaryote. Il affecte plus de 90% des gènes humains, il est essentiel pour la diversité des protéines et toute mauvaise régulation des programmes d’épissage alternatif hautement spécifiques des tissus peut conduire à des maladies, comme le cancer. Cependant, les mécanismes de régulation de l’épissage alternatif spécifique aux cellules sont encore largement inconnus. De manière inattendue, au cours des 15 dernières années, il a été démontré que la chromatine et les modifications épigénétiques jouent un rôle important dans la régulation de l’épissage alternatif.

Réalisations

En utilisant différentes approches, de l’ensemble du génome à des gènes spécifiques, nous avons montré que les marques d’histones sont suffisantes et nécessaires pour induire les changements d’épissage alternatif nécessaires à une TEM. De plus, ces marques d’histones associées à l’épissage jouent un rôle combinatoire en coordonnant l’épissage alternatif de gènes fonctionnellement liés de manière très dynamique, ce qui suggère que les réponses rapides d’épissage pourraient également être régulées par l’épigénétique.

Projets

Notre groupe vise à mieux comprendre le rôle de l’épigénétique dans l’apparition et le maintien de programmes d’épissage spécifiques aux tissus, en utilisant comme système modèle de reprogrammation cellulaire inductible la transition épithéliale-mésenchymateuse (TEM). À cette fin, nous utilisons des approches de séquençage profond de l’ensemble du génome (RNA-seq, ChIP-seq, CUT&Run, 4C-seq), qui, combinées à des outils de biologie moléculaire et cellulaire de pointe, tels que les outils CRISPRS-dCas9, nous aideront à mieux comprendre l’impact des modifications des histones et de l’organisation chromatinienne 3D dans l’établissement d’un nouveau programme d’épissage nécessaire à la reprogrammation cellulaire pendant la TEM.