Vivien Béziat

Les oncovirus muco-cutanés sont des virus à ADN qui peuvent provoquer des tumeurs épithéliales. Trois virus sont actuellement reconnus comme virus oncogènes muco-cutanés chez l’homme : le virus de l’herpès associé au sarcome de Kaposi (KSHV, également connu sous le nom de HHV8), les papillomavirus humains (VPH) et le polyomavirus de Merkel (MCPyV). Les phénotypes cliniques résultant de l’infection par ces oncovirus vont de l’infection asymptomatique aux cancers invasifs. Par exemple, les cancers anogénitaux induits par le VPH restent une cause principale de décès chez les femmes dans le monde. Les patients présentant des déficits immunitaires héréditaires sont sujets au développement de maladies infectieuses causées par un spectre étroit ou large d’agents pathogènes, y compris les oncovirus dans certains cas.

L’équipe travaille autour de deux axes principaux de recherche :

Génétique de l’immunité contre les oncovirus muco-cutanés

Grâce à un réseau national et mondial de collaborateurs, nous recrutons des patients atteints du sarcome de Kaposi, de verrues muco-cutanées sévères, de tumeurs de Buschke-Löwenstein ou du syndrome de « l’homme arbre », deux tumeurs bénignes dévastatrices provoquées respectivement par le VPH6 et le VPH2. Grâce au séquençage à haut débit (séquençage de l’exome entier ou du génome entier) et à la génétique des populations, nous recherchons des variations génétiques pouvant être à l’origine de ces maladies. Les variations candidates sont validées à l’aide d’approches expérimentales de biologie moléculaire, biochimie, immunologie et virologie. Récemment, notre équipe a rapporté le déficit en CARMIL2 chez des patients souffrant d’un déficit immunitaire combiné et de verrues récalcitrantes, et le déficit en CD28 chez des patients souffrant de verrues récalcitrantes, dont un patient souffrant du syndrome de « l’homme arbre ». 

Étude de la réponse immunitaire in situ contre le VPH grâce à différents modèles de déficits immunitaires héréditaires

Bien que le VPH soit un pathogène humain connu de longue date, la réponse immunitaire à son encontre reste très mal caractérisée, notamment à cause d’une difficulté d’accès à des échantillons de verrues en régression, et parce que la majorité des études sont réalisées à partir de sang, alors que l’infection a lieu dans les tissus. Afin de pallier à ce manque de connaissance, qui nuit à notre compréhension de la maladie des patients étudiés par l’équipe, nous utilisons des technologies de pointe telles que la cytométrie de masse, l’imagerie par cytométrie de masse (IMC) couplée à des approches analytiques basées sur l’intelligence artificielle, ou différentes approches de séquençage de l’ARN à l’échelle unicellulaire à partir d’échantillons de sang ou de peau (scRNAseq). Couplées à un accès unique à des modèles humains de régression ou de persistance virale, ces nouvelles technologies nous permettent d’étudier avec un niveau de précision inégalé la réponse immunitaire contre le VPH dans la peau.

Dans leur ensemble, nos travaux ont pour objectif d’apporter une meilleure compréhension de l’immunité muco-cutanée contre les oncovirus, dans ses composantes leucocytaires et non leucocytaires. À plus long terme, notre ambition est d’appliquer les connaissances acquises afin d’améliorer la prise en charge des pathologies muco-cutanées.